审计在工程投标报价中会扣除规费，主要原因是 施工单位没有规费核定表。规费是指国家规定必须缴纳的费用，包括社会保险费、住房公积金等，这些费用通常按照一定比例计取，并需要按照相关法规和标准进行缴纳。在工程投标报价中，规费是作为总成本的一部分被计入的。然而，如果施工单位没有提供规费核定表，审计部门将无法确